Разработка алгоритмов и веб-сервиса для автоматизации анализа данных в поведенческом тесте «Водный лабиринт Морриса»

6 Jul 2023, 14:15
15m
Room 437

Room 437

Workshop "Computing for radiobiology and medicine" Workshop "Computing for radiobiology and medicine"

Speaker

Tatevik Bezhanyan (LIT JINR)

Description

На базе методов компьютерного зрения разработаны алгоритмы анализа видеоданных полученных при проведении поведенческого теста «Водный лабиринт Морриса», который применяется для оценки функции памяти и обучения пространственной памяти, у мелких лабораторных животных. Работа велась в рамках совместного проекта ЛИТ и ЛРБ ОИЯИ. Для удобства и верификации правильности получаемых траекторий передвижений лабораторных животных разработан веб-сервис, позволяющий автоматизировать анализ видеоданных։ загружать экспериментальные видеофайлы и анализировать полученные траектории движения, формировать размеченный набор данных. Разрабатывается модуль веб-сервиса для классификации траекторий движений лабораторных грызунов (стратегии поиска) с применением нейросетевого подхода. Для этого готовится аннотированный набор данных, включающий в себя разметку поля установки («Водный лабиринт Морриса») и построение траекторий. Разработка проводится на базе экоситсемы ML/DL/HPC Гетерогенной вычислительной платформы HybriLIT.

Primary author

Co-authors

Presentation materials